Johtoryhmä
Johtoryhmän muodostavat toimitusjohtaja (pj.), talousjohtaja, kauko- ja kaupunkiliikennejohtajat, logistiikkajohtaja, henkilöstöjohtaja, liikenne- ja turvallisuusjohtaja, VR FleetCaren toimitusjohtaja, viestintäjohtaja sekä lakiasiainjohtaja.
Toimitusjohtaja hoitaa konsernin juoksevaa hallintoa hallituksen antamien ohjeiden ja määräysten mukaisesti. Toimitusjohtajan valitsee ja erottaa yhtiön hallitus, joka määrää myös palkkauksen.
Johtoryhmä kokoontuu yleensä kerran kuukaudessa, ja sen puheenjohtajana toimii VR-Yhtymä Oyj:n toimitusjohtaja.

Elisa Markula
- S. 1966, KTM
- Toimitusjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Työskennellyt VR:llä vuodesta 2022 alkaen
- Toiminut aiemmin Oriolan ja Tikkurilan toimitusjohtajana sekä Pauligin Kahvi-divisioonan johtajana

Laura Ansaharju
- S. 1977, DI
- Henkilöstöjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä vuodesta 2022 alkaen
- Työskennellyt aiemmin Finnairilla vuodesta 2011 lähtien erilaisissa henkilöstön johto- ja kehittämistehtävissä ja tätä ennen Stora Ensolla

Ilkka Heiskanen
- S. 1984, DI, tuotantotalous
- Liikenne- ja turvallisuusjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä vuodesta 2009 alkaen
- Työskennellyt aiemmin yhtiön strategia- ja kehitysjohtajana, VR Transpointin tuotantojohtajana ja suunnittelupäällikkönä sekä liiketoiminnan kehitystehtävissä VR Transpointissa ja VR Groupissa. Lisäksi taustaa liikkeenjohdon konsulttina Bain & Companyssä ja Booz Allen Hamiltonissa

Otso Ikonen
- S. 1976, DI, KTM
- Kunnossapitojohtaja, VR FleetCare Oy
- Toiminut VR:llä vuodesta 2022 lähtien
- Työskennellyt aiemmin ABB:llä kansainvälisissä liiketoiminnan johtotehtävissä, Helsingin konetehtaan johtajana ja useissa muissa vastuurooleissa sekä Wexon Oy:n toimitusjohtajana

Eljas Koistinen
- S. 1978, Executive MBA, tradenomi (AMK)
- VR Transpointin johtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Työskennellyt VR:llä vuodesta 2017 lähtien VR Transpointin myynti-, tuotanto- ja kaupallisen johtajan tehtävissä. Toiminut yhtiössä myös aiemmin vuosina 2006–2017 logistiikan avainasiakas- ja myyntipäällikön rooleissa
- Toiminut myyntijohtajana Geodis Wilson Finland Oy:ssä ja asiakkuuksien johtamisen parissa Lindström Oy:ssä. Aiempaa kokemusta myös Rautaruukki Oyj:n palveluksesta

Erkka Repo
- S. 1970, KTM
- Talousjohtaja (CFO), VR-Yhtymä Oyj
- Työskennellyt VR:llä vuodesta 2021 lähtien
- Toiminut aiemmin UPM:n taloudesta vastaavana johtajana

Mira Linnamaa
- Vt. viestintäjohtaja, VR-Yhtymä Oyj

Topi Simola
- S. 1976, KTM
- Kaupunkiliikennejohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä aiemmin matkustajaliikennejohtajana vuosina 2019–2022 sekä vuosina 2011–2017 konsernin kehitysjohtajana ja lähiliikennejohtajana
- Työskennellyt aiemmin mm. Cabonline Finlandin toimitusjohtajana sekä liikkeenjohdon konsulttina Accenturella ja Synergyllä (KPMG)

Teemu Sipilä
- s. 1974, OTM, eMBA
- Lakiasiainjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä vuodesta 2023 alkaen. Työskennellyt VR:llä myös aiemmin eri tehtävissä vuosina 2010–2020: lähiliikennejohtajana, silloisen VR Trackin vt. toimitusjohtajana sekä lakiasiainjohtajana
- Työskennellyt GlucoModicum Oy:n lakiasioiden johtajana, yrittäjänä ja lakiasioiden neuvonantajana. Taustaa myös mm. Fortumin sekä Castrén & Snellmanin palveluksesta

Piia Tyynilä
- S. 1973, restonomi
- Kaukoliikennejohtaja, VR-Yhtymä Oyj, ja toimitusjohtaja, Avecra Oy
- Työskennellyt VR:llä ja Avecralla vuodesta 2007 lähtien
- Toiminut aiemmin VR:n palvelujohtajana ja eri tehtävissä Avecralla. Tätä ennen taustaa palveluliiketoiminnan johtotehtävistä mm. SOK:n ja Picnic Finland Oy:n palveluksesta