Johtoryhmä
Johtoryhmä kokoontuu yleensä kerran viikossa, ja sen puheenjohtajana toimii VR-Yhtymä Oyj:n toimitusjohtaja.
Toimitusjohtaja hoitaa yhtiön juoksevaa hallintoa hallituksen antamien ohjeiden ja määräysten mukaisesti. Toimitusjohtajan valitsee ja erottaa yhtiön hallitus, joka määrää myös palkkauksen.

Elisa Markula
- S. 1966, KTM
- Toimitusjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Työskennellyt VR:llä vuodesta 2022 alkaen
- Toiminut aiemmin Oriolan ja Tikkurilan toimitusjohtajana sekä Pauligin Kahvi-divisioonan johtajana

Laura Ansaharju
- S. 1977, DI
- Henkilöstöjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä vuodesta 2022 alkaen
- Työskennellyt aiemmin Finnairilla vuodesta 2011 lähtien erilaisissa henkilöstön johto- ja kehittämistehtävissä ja tätä ennen Stora Ensolla

Ilkka Heiskanen
- S. 1984, DI, tuotantotalous
- Liikenne- ja turvallisuusjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä vuodesta 2009 alkaen
- Työskennellyt aiemmin yhtiön strategia- ja kehitysjohtajana, VR Transpointin tuotantojohtajana ja suunnittelupäällikkönä sekä liiketoiminnan kehitystehtävissä VR Transpointissa ja VR Groupissa. Lisäksi taustaa liikkeenjohdon konsulttina Bain & Companyssä ja Booz Allen Hamiltonissa

Otso Ikonen
- S. 1976, DI, KTM
- Kunnossapitojohtaja, VR FleetCare Oy
- Toiminut VR:llä vuodesta 2022 lähtien
- Työskennellyt aiemmin ABB:llä kansainvälisissä liiketoiminnan johtotehtävissä, Helsingin konetehtaan johtajana ja useissa muissa vastuurooleissa sekä Wexon Oy:n toimitusjohtajana

Eljas Koistinen
- S. 1978, Executive MBA, tradenomi (AMK)
- VR Transpointin johtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Työskennellyt VR:llä vuodesta 2017 lähtien VR Transpointin myynti-, tuotanto- ja kaupallisen johtajan tehtävissä. Toiminut yhtiössä myös aiemmin vuosina 2006–2017 logistiikan avainasiakas- ja myyntipäällikön rooleissa
- Toiminut myyntijohtajana Geodis Wilson Finland Oy:ssä ja asiakkuuksien johtamisen parissa Lindström Oy:ssä. Aiempaa kokemusta myös Rautaruukki Oyj:n palveluksesta

Erkka Repo
- S. 1970, KTM
- Talousjohtaja (CFO), VR-Yhtymä Oyj
- Työskennellyt VR:llä vuodesta 2021 lähtien
- Toiminut aiemmin UPM:n taloudesta vastaavana johtajana

Topi Simola
- S. 1976, KTM
- Kaupunkiliikennejohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä aiemmin matkustajaliikennejohtajana vuosina 2019–2022 sekä vuosina 2011–2017 konsernin kehitysjohtajana ja lähiliikennejohtajana
- Työskennellyt aiemmin mm. Cabonline Finlandin toimitusjohtajana sekä liikkeenjohdon konsulttina Accenturella ja Synergyllä (KPMG)

Teemu Sipilä
- Lakiasiainjohtaja, VR-Yhtymä Oyj (23.1.2023 alkaen)

Tatu Tuominen
- S. 1969, YTM
- Viestintäjohtaja, VR-Yhtymä Oyj
- Toiminut VR:llä vuodesta 2018 alkaen
- Työskennellyt aiemmin viestintä- ja yhteiskuntasuhdejohtajana Telialla ja sitä ennen eri tehtävissä ulkoministeriössä ja liikenne- ja viestintäministeriössä

Piia Tyynilä
- Kaukoliikennejohtaja, VR-Yhtymä Oyj